無塵車間交付后，在使用過程中需要在各個環節進行防控，防止出錯。污染和交叉污染的發生是GMP核心之一。交叉污染是指通過人員往返、工具運輸、物料傳遞、空氣流動、設備清洗消毒、崗位清理等方式，將不同品種的藥物成分混合，造成污染，或由于人工、工具、物料、空氣等不當流向，將低潔凈度區域的污染物傳入高潔凈度區域，造成交叉污染。那么，如何防止交叉污染呢?潔凈廠房設計規范明確指出，潔凈廠房“工藝平面布置應合理緊湊。潔凈室或潔凈區只布置必要的工藝設備、空氣潔凈度要求的工藝和工作室”。
空間面積布局合理
合理布局首先要理順工藝流程，避免迂回。工作室的平面空間應合理，有利于操作和維護，不得預留閑置面積和空間。合理的空間和面積也有利于合理的分區，防止混合事故。需要注意的是，潔凈室越大越好。面積和空間的大小關系到送風量，決定了空調的能耗，影響了項目的投資。但潔凈室的空間面積不宜太小，太小可能不方便操作和維護。因此，設計合理的空間面積應考慮設備操作和維護的需要。
提高設備水平
設備的材料、加工精度、密封性和管理體系都與交叉污染有關。因此，除了合理布局外，防止交叉污染的必要措施是提高設備的自動化水平，形成聯動生產線，降低操作人員和人員的活動頻率。固體制劑車間產生大量粉塵。采購的設備應配備防護罩和除塵裝置;其次，應采取隔離措施，分為操作室、前室或操作室和輔助機房。前室一般采用單布置，輔助室可設置在非潔凈區，維修門設置在走廊一側。如壓片、自動包裝、膠囊包裝等設備可采用此類分離方法。
分為空調凈化系統
潔凈室空調凈化系統應根據不同的潔凈度等級進行分類。對于潔凈度等級不同的潔凈室，產生粉塵和有害氣體的潔凈室，排氣介質毒性大，易燃易爆氣體的崗位應單獨設置局部排氣系統。潔凈室的排氣口應設倒灌裝置。送風、回風回風、排風的啟閉應設有連鎖裝置。
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